尊经阁始建于明弘治十七年(公元1504年)，揭阳知县童琰（云南举人），大举兴建；光绪二年（公元1876年）重建，因当时资金不足，而无法修缮，后倒塌；1964年改为篮球场；现存的建筑为2014年按照光绪年间的图纸格局仿建。
尊经阁原本为藏书之所，广储儒家经典及古籍善本，以供学宫生员博览经籍，阅读研求，对揭阳读书风气的推动影响十分深远，现辟为临时展厅，不定时举办各种专题展览。
